独立的医科大学里面没有985大学，不过很多985大学里面设置有医学院，如北京协和医学院、首都医科大学、南方医科大学、北京中医药大学、天津医科大学、哈尔滨医科大学等。
| 名次 | 学校名称 | 全国排名 | 办学层次 |
| 1 | 北京协和医学院 | 56 | 世界高水平、中国顶尖大学 |
| 2 | 首都医科大学 | 100 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 3 | 南方医科大学 | 114 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 4 | 北京中医药大学 | 115 | 世界高水平、中国顶尖大学 |
| 5 | 天津医科大学 | 124 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 6 | 哈尔滨医科大学 | 125 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 7 | 中国药科大学 | 127 | 世界知名、中国一流大学 |
| 8 | 上海中医药大学 | 134 | 世界知名、中国一流大学 |
| 9 | 南京医科大学 | 139 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 10 | 中国医科大学 | 157 | 中国知名、区域一流大学 |
| 11 | 重庆医科大学 | 166 | 中国知名、区域一流大学 |
| 12 | 广州中医药大学 | 181 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 13 | 南京中医药大学 | 182 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 14 | 天津中医药大学 | 184 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 15 | 温州医科大学 | 191 | 中国知名、区域一流大学 |
| 16 | 成都中医药大学 | 219 | 中国知名、区域一流大学 |
| 17 | 大连医科大学 | 222 | 中国知名、区域一流大学 |
| 18 | 安徽医科大学 | 229 | 中国知名、区域一流大学 |
| 18 | 河北医科大学 | 229 | 中国知名、区域一流大学 |
| 20 | 黑龙江中医药大学 | 234 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 21 | 广州医科大学 | 250 | 中国知名、区域一流大学 |
| 22 | 广西医科大学 | 253 | 区域高水平大学 |
| 23 | 新疆医科大学 | 254 | 区域高水平大学 |
| 24 | 沈阳药科大学 | 262 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 25 | 泰山医学院 | 273 | 区域高水平大学 |
| 26 | 宁夏医科大学 | 282 | 区域高水平大学 |
| 27 | 福建医科大学 | 290 | 区域高水平大学 |
| 28 | 河南中医药大学 | 296 | 中国知名、区域一流大学 |
| 29 | 湖南中医药大学 | 299 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 29 | 浙江中医药大学 | 299 | 世界知名、中国高水平大学 |
| 31 | 山东中医药大学 | 309 | 中国知名、区域一流大学 |
| 32 | 江西中医药大学 | 317 | 中国知名、区域一流大学 |
| 33 | 辽宁中医药大学 | 330 | 中国知名、区域一流大学 |
| 34 | 长春中医药大学 | 335 | 区域高水平大学 |
| 35 | 山西医科大学 | 338 | 区域高水平大学 |
| 36 | 福建中医药大学 | 345 | 区域高水平大学 |
| 37 | 湖北中医药大学 | 348 | 区域高水平大学 |
| 38 | 昆明医科大学 | 357 | 区域高水平大学 |
| 39 | 贵州医科大学 | 367 | 区域高水平大学 |
| 40 | 徐州医科大学 | 383 | 区域高水平大学 |
| 41 | 安徽中医药大学 | 394 | 区域高水平大学 |
| 41 | 广西中医药大学 | 394 | 区域高水平大学 |
| 41 | 贵阳中医学院 | 394 | 区域高水平大学 |
| 41 | 锦州医科大学 | 394 | 区域知名大学 |
| 45 | 新乡医学院 | 403 | 区域知名大学 |
| 45 | 遵义医学院 | 403 | 区域知名大学 |
| 47 | 广东药科大学 | 413 | 区域高水平大学 |
| 48 | 广东医科大学 | 424 | 区域高水平大学 |
| 48 | 海南医学院 | 424 | 区域知名大学 |
| 50 | 陕西中医药大学 | 430 | 区域高水平大学 |
| 51 | 西南医科大学 | 435 | 区域知名大学 |
| 52 | 内蒙古医科大学 | 452 | 区域知名大学 |
| 53 | 甘肃中医药大学 | 458 | 区域高水平大学 |
| 53 | 桂林医学院 | 458 | 区域知名大学 |
| 55 | 潍坊医学院 | 486 | 区域高水平大学 |
| 55 | 川北医学院 | 486 | 区域知名大学 |
| 55 | 山西中医药大学 | 486 | 区域知名大学 |
| 55 | 右江民族医学院 | 486 | 区域知名大学 |
| 59 | 云南中医学院 | 493 | 区域高水平大学 |
| 59 | 济宁医学院 | 493 | 区域知名大学 |
| 59 | 皖南医学院 | 493 | 区域知名大学 |
| 62 | 蚌埠医学院 | 507 | 区域知名大学 |
| 63 | 牡丹江医学院 | 518 | 区域知名大学 |
| 64 | 滨州医学院 | 531 | 区域知名大学 |
| 64 | 承德医学院 | 531 | 区域知名大学 |
| 64 | 西安医学院 | 531 | 区域知名大学 |
| 67 | 湖北医药学院 | 547 | 区域知名大学 |
| 68 | 成都医学院 | 552 | 区域知名大学 |
| 68 | 沈阳医学院 | 552 | 区域知名大学 |
| 70 | 长治医学院 | 563 | 区域知名大学 |
| 70 | 河北北方学院 | 563 | 区域知名大学 |
| 72 | 赣南医学院 | 590 | 区域知名大学 |
| 72 | 吉林医药学院 | 590 | 区域知名大学 |
| 72 | 齐齐哈尔医学院 | 590 | 区域知名大学 |
| 75 | 河北中医学院 | 607 | 区域知名大学 |
| 76 | 西藏藏医学院 | 617 | 区域知名大学 |
| 77 | 上海健康医学院 | 699 | 区域知名大学 |
| 78 | 湖南医药学院 | 702 | 区域知名大学 |
| 79 | 杭州医学院 | 706 | 区域知名大学 |
| 80 | 甘肃医学院 | 713 | 区域知名大学 |
| 81 | 厦门医学院 | 719 | 区域知名大学 |
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