根据福建农林大学最新招生计划数据查询，福建农林大学开设专业有水土保持与荒漠化防治、森林保护、自然地理与资源环境、林学、生态学、农学、植物科学与技术、种子科学与工程、材料科学与工程、木材科学与工程等，具体完整专业名单见下表。
| 院系设置 | 所有专业 |
|---|---|
| 林学院 | 水土保持与荒漠化防治，森林保护，自然地理与资源环境，林学，生态学 |
| 农学院 | 农学，植物科学与技术，种子科学与工程 |
| 材料工程学院 | 材料科学与工程，木材科学与工程，化学工程与工艺，新能源科学与工程，轻化工程 |
| 交通与土木工程学院 | 物流工程，森林工程，土木工程，交通运输类，工程管理 |
| 管理学院(旅游学院) | 人力资源管理，文化产业管理，工商管理，旅游管理，会计学 |
| 公共管理学院 | 土地资源管理，行政管理，公共事业管理，劳动与社会保障，法学 |
| 计算机与信息学院 | 信息与计算科学，计算机科学与技术，电子信息工程，数学与应用数学，软件工程，网络工程，统计学 |
| 生命科学学院 | 生物技术，应用化学，生物信息学，生物科学，生物工程 |
| 机电工程学院 | 农业机械化及其自动化，车辆工程，机械设计制造及其自动化，电气工程及其自动化，电子科学与技术 |
| 动物科学学院(蜂学学院) | 水产养殖学，动物医学，蜂学，中药资源与开发，动物科学 |
| 安溪茶学院(安溪校区) | 工商管理，茶学，旅游管理，会计学，管理科学，商务经济学 |
| 植物保护学院 | 植物保护，制药工程 |
| 资源与环境学院 | 农业资源与环境，环境工程，空间信息与数字技术，土地资源管理 |
| 园艺学院 | 设施农业科学与工程，茶学，园艺 |
| 经济学院(海峡乡村建设学院) | 农林经济管理，农村区域发展，国际经济与贸易，金融学 |
| 艺术学院园林学院(合署) | 园林，风景园林，视觉传达设计，产品设计，环境设计，城乡规划，动画 |
| 食品科学学院 | 食品卫生与营养学，食品科学与工程，食品质量与安全，食品科学与工程(闽台合作班) |
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