福建中医药大学招生专业共计有14个,分别有伤寒学、中医文献学、方剂学、中医诊断学、中医脾胃病学、中医骨伤科学、中医康复学、中医护理学、针灸学、中药化学、中西医结合临床等,具体更多完整招生专业请看下表。
| 序号 | 专业名称 | 学制 |
| 1 | 中医学 | 5 |
| 2 | 针灸推拿学 | 5 |
| 3 | 中西医临床医学 | 5 |
| 4 | 临床医学 | 5 |
| 5 | 中药学 | 4 |
| 6 | 药学 | 4 |
| 7 | 药物制剂 | 4 |
| 8 | 康复治疗学 | 4 |
| 9 | 公共事业管理 | 4 |
| 10 | 信息管理与信息系统 | 4 |
| 11 | 护理学 | 4 |
| 12 | 医学影像技术(闽台合作项目) | 4 |
| 13 | 食品科学与工程(闽台合作项目) | 4 |
| 14 | 康复治疗学(闽台合作项目) | 4 |
2.国家中医药管理局重点学科:伤寒学、中医文献学、方剂学、中医诊断学、中医脾胃病学、中医骨伤科学、中医康复学、中医护理学、针灸学、中药化学、中西医结合临床、内经学、中医急诊学、中医养生学、推拿学、中药分析学、临床中药学、中西医结合基础、中医心理学、中医预防医学
3.福建省重点学科:中西医结合、护理学、康复医学、临床医学、药学、中药学、中医学
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