2011年温州医学院检验医学与生命科学学院招收调剂生信息
我校检验医学与生命科学学院现有部分学术型研究生面向全国接受调剂,均为全公费名额,有关事项如下:
一、研究团队简介
研究团队隶属于温州医学院检验医学与生命科学学院,尤其是检验医学专业的学科力量在全国名列前茅。团队研究平台建立在温州医学院医学遗传学教育部重点实验室及浙江省实验动物技术中心、浙江省医学遗传学重点实验室,并且列为浙江省重中之重建设学科,现有硕士生导师如下:
1)包其郁教授,享受国务院政府特殊津贴,现从事微生物学、基因组生物信息学、生物化学和法医物证学方向科研工作。2002 年在中科院遗传与发育生物学研究所获博士学位,参加了“人类基因组计划”和“水稻基因组计划”,为第一作者完成了“腾冲嗜热厌氧菌全基因组分析”,该研究为国内首次获得了一张原核生物全基因组序列图谱,填补了我国在此研究领域的空白,曾获“中国科学院院长特别奖”。
2) 李劲松博士,副教授,现从事病原微生物基因组结构与功能、耐药致病菌机理研究;
3)王慧利博士,副教授,现从事生物化学、分子生物学、微生物学方向研究;
二、硬件设施
1)分子毒理学研究平台,拥有多种实验动物养殖中心、疾病模型创建平台及水生生物养殖系统,另外具有专用的暴毒实验室,胚胎细胞和精子冷冻室,细胞培养室,行为分析仪器和生化与分子生物学常规仪器,此外建有水生动物及藻类的培养室;
2)生物信息研究平台,拥有有强大的计算平台(曙光3000,IBMp690),已经建立起了非编码RNA 和靶基因预测鉴定流程。生物信息分析成员对比较基因组学、microRNA、sRNA 及靶基因的预测、microRNA 的芯片表达谱分析、microRNA 调控网络的基础理论和生物信息学分析有着系统全面的实践经验。
3)另外常规仪器有:激光共聚焦显微镜(Olympus FV1000 + SIMS )、流式细胞分析仪(BD FACS Aria)、Varioskan Flash 光谱扫描多功能读数仪(Thermo Scientific)、荧光分光光度计、核酸蛋白分析仪(Beckman Coulter DU800)、荧光定量PCR 仪(MJOpticon2)、原子力显微镜、扫描遂道显微镜、高效液相色谱仪、DN 合成仪、基因
分析系统(Beckman Coulter CEQ8800)、透射式电子显微镜(日立H-7500)、超速离心机(Beckman Coulter OPTIMA L-100XP)、核苷酸片段分析系统(Transgenomic WAVE2100 )、蛋白质组学工作站(Bio-Rad)、AKTA Purifier 蛋白纯化系统(GEhealthcare)、HP 570G3 超级大型服务器、SUN450 服务器以及比较基因组学和分子进化分析实验室等相关数据分析设备、激光粒度仪、全自动DNA 测序仪、蛋白质组学研究的全套设备、凝胶电脉、图像分析系统等。此外建有水生动物及藻类的培养室。
三、研究课题:
1、)国家自然科学基金“人体内和细胞传代培养SARS病毒基因组的遗传变异研究”;
2、)国家自然科学基金“螺旋藻全基因生物信息分析”;
3、)国家973 计划课题“农业微生物杀虫防病功能基因的发掘和分子机理研究”;
4、)国家自然科学基金“螺旋藻全基因组中与环境胁迫应答有关的sRNA 的寻找与调控网络研究”;
5、)浙江省自然科学基金“双酮类抗生素痕量浓度污染对斑马鱼生态毒理的分子机理研究”等。
四、近两年发表SCI收录论文(附录一)。
五、招收人数、条件与待遇:
1) 总分必须过国家线;
2、)一旦录取,均为全额公费,学生每月生活补助600 元;
六、优先考虑的报考方向:
1、)检验医学专业;
2、)遗传学专业。
七、有意调剂者请联系如下人员:
包老师:
手机13004725388 办公室0577-86699398 邮箱baoqywzmc@yahoo.com.cn
王老师:
手机15057769199 办公室0577-86699652 邮箱whuili@163.com
附录一:近年来发表的部分SCI收录论文目录:
1. Qiyu Bao, Yuqing Tian, Wei Li, Huanming Yang , et al. A Complete Sequence of the T.tengcongensis Genome. Genome Research, 2002,12(5):689-700.(SCI,IF:
10.1)
2. Zhang, Y*, Bao Q*, Gagnon LA, Huletsky A, Oliver A, Jin S, Langaee T. ampG gene of Pseudomonas aeruginosa and its role in {beta}-lactamase expression. Antimicro and Chemotherapy . 2010 Aug 16.
3. Zhao F, Bai J, Wu J, Bao Q* et al., Sequencing and genetic variation of multidrug resistance plasmids in clinical samples. PlosOne, 2010, 5(4):e10141. (*通讯作者,SCI,IF:4.352)
4. Huiguang Yi, Yali Xi, Jing Liu, Junrong Wang, Jinyu Wu, Teng Xu, Wei Chen, Biaobang Chen, Meili Lin, Huan Wang, Mingming Zhou, Jinsong Li, Zuyuan Xu, Shouguang Jin, Qiyu Bao*. Sequence Analysis of pKF3-70 in Klebsiella pneumoniae: Probable Origin from R100-like Plasmid of Escherichia coli. PLoS One. 2010, 5 (1):e8601. (*通讯作者(SCI,IF:4.352)
5. Guiming Liu, Jinyu Wu, Huanming Yang, Qiyu Bao*. Codon Usage Patterns in Corynebacterium glutamicum: Mutational Bias, Natural Selection and Amino Acid Conservation. Comp Funct Genomics. 2010; 2010:343569. Epub 2010 Apr 22. (*通讯作者,SCI)
6. Hou H, Zhao F, Zhou L, Zhu E, Teng H, Li X, Bao Q, Wu J, Sun Z. MagicViewer: integrated solution for next-generation sequencing data visualization and genetic variation detection and annotation. NucleicAcids Res. 2010 May 5. [Epub ahead of print]
7. Bai J, Wang J, Xue F, Li J, Bu L, Hu J, Xu G, Bao Q, Zhao G, Ding X, Yan J, Wu J. proTF: a comprehensive data and phylogenomics resource for prokaryotic transcription factors。Bioinformatics. 2010, 26 (19):2493-5.
8. JinyuWu, Tonghai Yu, Qiyu Bao*, and Fangqing Zhao,Evidence of Extensive Homologous Recombination in the Core Genome of Rickettsia. Comp Funct Genomics. 2009:510270. Epub 2009 May 25. (通讯作者,SCI,IF:
1.62)
9. Jinyu Wu, Xiang Xu, Jian Xiao, Long Xu, Huiguang Yi, Shengjie Gao, Jing Liu, Qiyu Bao*, Fangqing Zhao* and Xiaokun Li* FlyPhy: a phylogenomic analysis platform for Drosophila genes and gene families. BMC Bioinformatics. 2009 Apr 25;10:123. (通讯作者,SCI,IF:4.96)
10. Xiang Xu, Jinyu Wu, Jian Xiao, Yi Tan, Qiyu Bao*, Fangqing Zhao* and Xiaokun Li*。PlasmoGF: an integrated system for comparative genomics and phylogenetic analysis of Plasmodium gene families. Bioinformatics. 2008, 24 (9) : 1217-20. (*并列通讯作者,SCI,IF:5.1)
11. Wu J, Bai J, Bao Q, Zhao F. Lineage-Specific Domain Fusion in the Evolution of Purine Nucleotide Cyclases in Cyanobacteria. J Mol Evol. 2008, 67(1):85-94.(*通讯作者,SCI,IF:3.1)
12. Wu J, Zhao F, Wang S, Deng G, Wang J, Bai J, Lu J, Qu J, Bao Q*: cTFbase: a database for comparative genomics of transcription factors in cyanobacteria. BMC Genomics, 2007, 8:104. (通讯作者,SCI,IF:4.0)
13. Wang ZG, Xu SP, Zhang YJ, Bao QY. Genetic distance of SARS coronavirus from the recent natural case. VetMicrobiol. 2007, 120(1-2):
167-172. (SCI,IF:2.6)
14. Chao L, Qiyu B, Fuping S, Ming S, Dafang H, Guiming L, Ziniu Y: Complete nucleotide sequence of pBMB67, a 67-kb plasmid from Bacillus thuringiensis strain YBT-1520. Plasmid, 2007, 57(1):44-54.(SCI)
15. Ju-Yuan Zhang, Jie Zou, Qiyu Bao, Wen-Li Chen, Li Wang, Huanming Yang, Cheng-Cai Zhang. A lithium-sensitive and sodium-tolerant 3'-phosphoadenosine- 5'-phosphatase encoded by halA from the cyanobacterium Arthrospira platensis is closely related to its counterparts from yeasts and plants. Appl EnvironMicrobiol, 2006,72(1):245-51. (SCI)
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